Soubory GIF můžou obsahovat pouze 256 barev, takže nejsou vhodné pro fotografie ve vysokém rozlišení pořízené digitálními fotoaparáty. Pro fotografie obsahující ostré detaily jsou oblíbenější volbou soubory JPEG díky své schopnosti zobrazit miliony různých barev.
Mnoho memů ve formátu GIF sdílených na sociálních sítích obsahuje fragmenty materiálů chráněných autorskými právy, například snímky z filmů nebo od fotografických agentur. Držitelé autorských práv obvykle nepodnikají právní kroky proti lidem, kteří vytvářejí memy pro nekomerční použití, přesto je lepší být opatrnější. Společnosti využívající animované soubory GIF pro komerční účely by však měly při výběru obrázků GIF dodržovat místní pravidla a předpisy.
Mnoho online nástrojů pro tvorbu souborů GIF omezuje velikost souborů, které můžete vytvořit. Horní limit obvykle bývá 200 MB. Platí také časová omezení, u některých nástrojů je délka animovaného souboru GIF omezena na 15 sekund. Omezení počtu snímků v souboru také usnadňuje jeho správu.
Protože se nejedná o skutečné video soubory, nemůžou soubory GIF obsahovat zvuk. Chcete-li vytvářet animace obsahující současně obraz i zvuk, můžete použít oblíbené formáty souborů pro video, jako jsou AVI, MP4 a WEBM.
Formát PNG je novější než soubor GIF, ale nabízí podobné výhody, včetně bezztrátové komprese. Jedním z hlavních rozdílů je, že animace podporují pouze soubory GIF. Někteří lidé dávají pro statickou grafiku webových stránek přednost formátu PNG před GIF, protože dokáže zobrazit více než 16 milionů barev namísto pouhých 256.